Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMARCB1Q12824 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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