Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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