Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFCP2Q12800 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFCP2Q12800 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFCP2Q12800 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFCP2Q12800 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFCP2Q12800 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFCP2Q12800 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TFCP2Q12800 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFCP2Q12800 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
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