Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 PAU4YLR461W 363 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 CCL1YPR025C 1182 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 snR44snR44 211 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 ART10YLR392C 1557 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 AKR1YDR264C 2295 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 NHP10YDL002C 612 nt3.62□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RPS29BYDL061C 171 nt3.62□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RFA3YJL173C 369 nt3.62□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 MAK16YAL025C 921 nt3.62□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 AHP1YLR109W 531 nt3.62□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RIM11YMR139W 1113 nt3.62□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RPC34YNR003C 954 nt3.62□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 HUB1YNR032C-A 222 nt3.62□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 PEX27YOR193W 1131 nt3.62□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 snR17asnR17a 333 nt3.62□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 SPT23YKL020C 3249 nt3.62□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 AEP2YMR282C 1743 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 KRE5YOR336W 4098 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YDL162CYDL162C 357 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YGL230CYGL230C 444 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 PRP18YGR006W 756 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YHR054CYHR054C 1065 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 VPS25YJR102C 609 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 BUR2YLR226W 1188 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RPL19BYBL027W 570 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RCE1YMR274C 948 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 TIR2YOR010C 756 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 PRM4YPL156C 855 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 LCB5YLR260W 2064 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 TAF7YMR227C 1773 nt3.61□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RAD55YDR076W 1221 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 AIR1YIL079C 1083 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 PSF2YJL072C 642 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YJR128WYJR128W 360 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YKR070WYKR070W 1059 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 TRM112YNR046W 408 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RPB8YOR224C 441 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 SYT1YPR095C 3681 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 IOC2YLR095C 2439 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 AVT7YIL088C 1473 nt3.6□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 HCA4YJL033W 2313 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 OPI6YDL096C 327 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YFL012WYFL012W 447 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YGR190CYGR190C 366 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 PFS1YHR185C 714 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 AGE2YIL044C 897 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 GCD14YJL125C 1152 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 ERP1YAR002C-A 660 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 CSM3YMR048W 954 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 LDS2YOL047C 1071 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 GRX5YPL059W 453 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 GCN5YGR252W 1320 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YNR066CYNR066C 1311 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 ZDS1YMR273C 2748 nt3.59□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 CAF130YGR134W 3369 nt3.58□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 TRK1YJL129C 3708 nt3.58□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 COG7YGL005C 840 nt3.58□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 CFD1YIL003W 882 nt3.58□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 RPC25YKL144C 639 nt3.58□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 ERG29YMR134W 714 nt3.58□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 PIN3YPR154W 648 nt3.58□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 COM2YER130C 1332 nt3.58□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 YHR202WYHR202W 1809 nt3.58□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 YNR063WYNR063W 1824 nt3.58□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 MON1YGL124C 1935 nt3.58□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 MSR1YHR091C 1932 nt3.58□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 SPT16YGL207W 3108 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 TSC13YDL015C 933 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 SNU23YDL098C 585 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 YDL199CYDL199C 2064 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 HDA2YDR295C 2025 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 MEI4YER044C-A 1227 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 RPL22BYFL034C-A 369 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 TAN1YGL232W 870 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 VMA7YGR020C 357 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 TAM41YGR046W 1158 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 RPL24BYGR148C 468 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 PDX1YGR193C 1233 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 SPO11YHL022C 1197 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 EPT1YHR123W 1176 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 YJR111CYJR111C 852 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 URA5YML106W 681 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 END3YNL084C 1050 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 YOL106WYOL106W 354 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 RPS10AYOR293W 318 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 RDS2YPL133C 1341 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 GRS2YPR081C 1857 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 SUP45YBR143C 1314 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 MED8YBR193C 672 nt3.57□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 EXO5YBR163W 1758 nt3.56□□□□□ -1.84
CTF3Q12748 ALG8YOR067C 1734 nt3.56□□□□□ -1.84
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