Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YPR148CYPR148C 1308 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 SKO1YNL167C 1944 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 ALG11YNL048W 1647 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 FRE3YOR381W 2136 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 SYG1YIL047C 2709 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 SCS2YER120W 735 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YGL193CYGL193C 312 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YGR025WYGR025W 303 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 PAN6YIL145C 930 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 MRP17YKL003C 396 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 TFB2YPL122C 1542 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 GEP3YOR205C 1671 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 FMN1YDR236C 657 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YJL220WYJL220W 453 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YJR079WYJR079W 330 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 ATG10YLL042C 504 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YML108WYML108W 318 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 RPS19BYNL302C 435 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 OST2YOR103C 393 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 HES1YOR237W 1305 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 DBP3YGL078C 1572 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 PMA1YGL008C 2757 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 MAL11YGR289C 1851 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 SSE2YBR169C 2082 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 FAR7YFR008W 666 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 BSC3YLR465C 309 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 POP3YNL282W 588 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 SOL1YNR034W 966 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YOP1YPR028W 543 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 VPS69YPR087W 321 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 ECM33YBR078W 1290 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 AIM4YBR194W 372 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 OXP1YKL215C 3861 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 ECM3YOR092W 1842 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 AAP1YHR047C 2571 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 FAR8YMR029C 1572 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YCR007CYCR007C 720 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 PER1YCR044C 1074 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YDR154CYDR154C 351 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 CAB4YGR277C 918 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 MRPL31YKL138C 396 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 SUS1YBR111W-A 291 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YCL012CYCL012C 405 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 PUF3YLL013C 2640 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 NTH1YDR001C 2256 nt4.84□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 RBA50YDR527W 1320 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 RPS16BYDL083C 432 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 DFG10YIL049W 762 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 DAD2YKR083C 402 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YLR126CYLR126C 756 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 CDC42YLR229C 576 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 RPL18BYNL301C 561 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 SER33YIL074C 1410 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 HNT1YDL125C 477 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 PGU1YJR153W 1086 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 APS1YLR170C 471 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 ATP14YLR295C 375 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 PDP3YLR455W 915 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 MED11YMR112C 396 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YPL035CYPL035C 348 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 FPK1YNR047W 2682 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 MIH1YMR036C 1665 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 KIP2YPL155C 2121 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 ARG4YHR018C 1392 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 PAM1YDR251W 2493 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 NHP2YDL208W 471 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 TFB3YDR460W 966 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YGL108CYGL108C 423 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 PHO86YJL117W 936 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YJR111CYJR111C 852 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 OAR1YKL055C 837 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YKL107WYKL107W 930 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YAR029WYAR029W 225 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 NSL1YPL233W 651 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 HPA2YPR193C 471 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 CAB3YKL088W 1716 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YHR045WYHR045W 1683 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 CTS1YLR286C 1689 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YJR098CYJR098C 1971 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 HPR1YDR138W 2259 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 ANR2YKL047W 1551 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 ADY2YCR010C 852 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YPD1YDL235C 504 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YDR413CYDR413C 576 nt4.8□□□□□ -1.64
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