Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 NDC80YIL144W 2076 nt3.3□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 FLO1YAR050W 4614 nt3.3□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 SGS1YMR190C 4344 nt3.29□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 MSA1YOR066W 1890 nt3.29□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 REV3YPL167C 4515 nt3.29□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 RPS21AYKR057W 264 nt3.29□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 SHG1YBR258C 429 nt3.29□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 YDL176WYDL176W 2127 nt3.29□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 SEC59YMR013C 1560 nt3.29□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 EBS1YDR206W 2655 nt3.28□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 CLG1YGL215W 1359 nt3.28□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 ERG9YHR190W 1335 nt3.28□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 YOS1YER074W-A 258 nt3.28□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 USE1YGL098W 738 nt3.28□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 TMA10YLR327C 261 nt3.28□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 YOL107WYOL107W 1029 nt3.28□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 CHA4YLR098C 1947 nt3.28□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 TEC1YBR083W 1461 nt3.28□□□□□ -1.88
TY3A-GQ12173 REG1YDR028C 3045 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 DBP5YOR046C 1449 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YPL216WYPL216W 3309 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 MIP6YHR015W 1980 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 FLO9YAL063C 3969 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 CIN8YEL061C 3003 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 PEA2YER149C 1263 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 SPT2YER161C 1002 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 KXD1YGL079W 657 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YIR040CYIR040C 333 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 PAU23YLR037C 375 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 COQ9YLR201C 783 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 SMA2YML066C 1110 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 HHF1YBR009C 312 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 MGR3YMR115W 1506 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 CHS3YBR023C 3498 nt3.27□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 IOC3YFR013W 2364 nt3.26□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 PCI8YIL071C 1335 nt3.26□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YHP1YDR451C 1062 nt3.26□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 MMS21YEL019C 804 nt3.26□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 ERG26YGL001C 1050 nt3.26□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt3.26□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt3.26□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 THP2YHR167W 786 nt3.26□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.26□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YAR069CYAR069C 294 nt3.26□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 SPO14YKR031C 5052 nt3.26□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 HAP4YKL109W 1665 nt3.26□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 MPC54YOR177C 1395 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YLR001CYLR001C 2589 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 VBA4YDR119W 2307 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 SNT1YCR033W 3681 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YCL076WYCL076W 744 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 RPS29BYDL061C 171 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 RRP8YDR083W 1179 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YER147C-AYER147C-A 411 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 SDP1YIL113W 630 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 AIM25YJR100C 984 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 AIM41YOR215C 558 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 RPS11BYBR048W 471 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YPS6YIR039C 1614 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 UBP8YMR223W 1416 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 FUN30YAL019W 3396 nt3.25□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 MSS2YDL107W 1056 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YDL162CYDL162C 357 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 TGL2YDR058C 981 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 RPL1BYGL135W 654 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 MPC3YGR243W 441 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YHL005CYHL005C 393 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 ARD1YHR013C 717 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 MDV1YJL112W 2145 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 SAW1YAL027W 786 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YJR111CYJR111C 852 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 DSE3YOR264W 1293 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 RPL1AYPL220W 654 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 RPN3YER021W 1572 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 TCP1YDR212W 1680 nt3.24□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YAK1YJL141C 2424 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 HMS1YOR032C 1305 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 ENA5YDR038C 3276 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YDR340WYDR340W 303 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 ERP6YGL002W 651 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 LST7YGR057C 729 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 SPO16YHR153C 597 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 VTC4YJL012C 2166 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 IME1YJR094C 1083 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YLR225CYLR225C 1224 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 YLR257WYLR257W 966 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 HSH49YOR319W 642 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 MSH2YOL090W 2895 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 RAD7YJR052W 1698 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 MAK21YDR060W 3078 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 RIF1YBR275C 5751 nt3.23□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 SUP45YBR143C 1314 nt3.22□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 HBT1YDL223C 3141 nt3.22□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 FAS1YKL182W 6156 nt3.22□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 VPS41YDR080W 2979 nt3.22□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 AML1YGR001C 747 nt3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.4 ms