Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt6.15□□□□□ -1.42
YRR1Q12172 AST2YER101C 1293 nt6.15□□□□□ -1.42
YRR1Q12172 SAE2YGL175C 1038 nt6.15□□□□□ -1.42
YRR1Q12172 YIR020CYIR020C 303 nt6.15□□□□□ -1.42
YRR1Q12172 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt6.15□□□□□ -1.42
YRR1Q12172 YNL170WYNL170W 396 nt6.15□□□□□ -1.42
YRR1Q12172 RPS11BYBR048W 471 nt6.15□□□□□ -1.42
YRR1Q12172 YPR123CYPR123C 435 nt6.15□□□□□ -1.42
YRR1Q12172 RTC5YOR118W 1704 nt6.15□□□□□ -1.42
YRR1Q12172 LYS9YNR050C 1341 nt6.15□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 MPP10YJR002W 1782 nt6.15□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 PRP3YDR473C 1410 nt6.15□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 MEF1YLR069C 2286 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 FOB1YDR110W 1701 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 MCM3YEL032W 2916 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 REC104YHR157W 549 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 CRG1YHR209W 876 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 MRS1YIR021W 1092 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 RPL39YJL189W 156 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 CSE4YKL049C 690 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 ATG10YLL042C 504 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 PNP1YLR209C 936 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 CDC42YLR229C 576 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 RPS1BYML063W 768 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 IMP4YNL075W 873 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YNL184CYNL184C 327 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 TAF14YPL129W 735 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YPR098CYPR098C 486 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 MRPS5YBR251W 924 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 GNT1YOR320C 1476 nt6.14□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 GPB2YAL056W 2643 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 RSC30YHR056C 2652 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 BNA6YFR047C 888 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 PHO86YJL117W 936 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 RPL17BYJL177W 555 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 LSM8YJR022W 330 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YNL150WYNL150W 408 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 TRM112YNR046W 408 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 UBC11YOR339C 471 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 RBA50YDR527W 1320 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 MSE1YOL033W 1611 nt6.13□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SSF2YDR312W 1362 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 ERG4YGL012W 1422 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YGR151CYGR151C 336 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 CIS3YJL158C 684 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 IMA5YJL216C 1746 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 DAL5YJR152W 1632 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 ERI1YPL096C-A 207 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YPR099CYPR099C 357 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 DER1YBR201W 636 nt6.12□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 TRP5YGL026C 2124 nt6.11□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 ASI3YNL008C 2031 nt6.11□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 ANR2YKL047W 1551 nt6.11□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 AFG1YEL052W 1530 nt6.11□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 NGL3YML118W 1518 nt6.11□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.11□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 API2YDR525W 330 nt6.11□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 ISD11YER048W-A 285 nt6.11□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 TDA2YER071C 381 nt6.11□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 ERP4YOR016C 624 nt6.11□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt6.11□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 RAD3YER171W 2337 nt6.11□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 PAL1YDR348C 1500 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 RIO1YOR119C 1455 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 HRR25YPL204W 1485 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 STE5YDR103W 2754 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 TFB3YDR460W 966 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YFL032WYFL032W 321 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SEC53YFL045C 765 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 EFB1YAL003W 621 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YLR434CYLR434C 384 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 AFT2YPL202C 1251 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 GPB1YOR371C 2694 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 CDC5YMR001C 2118 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YML096WYML096W 1578 nt6.1□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 CHA4YLR098C 1947 nt6.09□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SWC4YGR002C 1431 nt6.09□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YGL152CYGL152C 678 nt6.09□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 DPH1YIL103W 1278 nt6.09□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YAL004WYAL004W 648 nt6.09□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 RPE1YJL121C 717 nt6.09□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 YJR012CYJR012C 624 nt6.09□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 SMA2YML066C 1110 nt6.09□□□□□ -1.43
YRR1Q12172 ATG12YBR217W 561 nt6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.3 ms