Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	RRI1	YDL216C	1323 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	SEM1	YDR363W-A	270 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	IMP3	YHR148W	552 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	SGN1	YIR001C	753 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	HMX1	YLR205C	954 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YBR300C	YBR300C	498 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YCL001W-A	YCL001W-A	462 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	JJJ1	YNL227C	1773 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	UBP5	YER144C	2418 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	ATG13	YPR185W	2217 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	EXO5	YBR163W	1758 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YDR336W	YDR336W	945 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	ISC10	YER180C	804 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	QCR10	YHR001W-A	234 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YJR111C	YJR111C	852 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	SFH1	YLR321C	1281 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	SSN8	YNL025C	972 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	EAF7	YNL136W	1278 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	COS1	YNL336W	1146 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YOL166C	YOL166C	339 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	PLM2	YDR501W	1566 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	SDS23	YGL056C	1584 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	MET10	YFR030W	3108 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	SEC15	YGL233W	2733 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	VBA4	YDR119W	2307 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	UBP8	YMR223W	1416 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	CHO2	YGR157W	2610 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	PDS1	YDR113C	1122 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	ENT5	YDR153C	1236 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	RNH202	YDR279W	1053 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YPR1	YDR368W	939 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	APA2	YDR530C	978 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	MRPL20	YKR085C	588 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	AAH1	YNL141W	1044 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	TUM1	YOR251C	915 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	MRPL51	YPR100W	423 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	SPP381	YBR152W	876 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	PMR1	YGL167C	2853 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	TFC4	YGR047C	3078 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	COM2	YER130C	1332 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	CMK1	YFR014C	1341 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	RPS29B	YDL061C	171 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YBR089W	YBR089W	600 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	FLO1	YAR050W	4614 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YGR237C	YGR237C	2358 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	SEC59	YMR013C	1560 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	PUF6	YDR496C	1971 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	XRN1	YGL173C	4587 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	RIT1	YMR283C	1542 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	BMH2	YDR099W	822 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	IZH1	YDR492W	951 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	RPL1B	YGL135W	654 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	COX18	YGR062C	951 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	IRC18	YJL037W	675 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	GMH1	YKR030W	822 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YLR416C	YLR416C	399 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	SSU72	YNL222W	621 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	RAS1	YOR101W	930 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	CAF20	YOR276W	486 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	RPL1A	YPL220W	654 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YPR074W-A	YPR074W-A	171 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	VPS17	YOR132W	1656 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	CET1	YPL228W	1650 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	MOT1	YPL082C	5604 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YPL109C	YPL109C	1974 nt		3	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	GCD6	YDR211W	2139 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	KRE2	YDR483W	1329 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	IPI3	YNL182C	1668 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	PRP8	YHR165C	7242 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	TAF2	YCR042C	4224 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	RDI1	YDL135C	609 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	AIM6	YDL237W	1173 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	TLG1	YDR468C	675 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	PNC1	YGL037C	651 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YIL156W-A	YIL156W-A	402 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	SWD2	YKL018W	990 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	HOT13	YKL084W	351 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YLR311C	YLR311C	348 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YML047W-A	YML047W-A	366 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	RSF1	YMR030W	1131 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YMR306C-A	YMR306C-A	390 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	PIN3	YPR154W	648 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YPS6	YIR039C	1614 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	SLH1	YGR271W	5904 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	RPN4	YDL020C	1596 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	AEP2	YMR282C	1743 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	TRM12	YML005W	1389 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	SHQ1	YIL104C	1524 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YNR063W	YNR063W	1824 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YDL162C	YDL162C	357 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YGR026W	YGR026W	837 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YHR214C-D	YHR214C-D	294 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	PCL7	YIL050W	858 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YIR014W	YIR014W	729 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	RPC37	YKR025W	849 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YAR069C	YAR069C	294 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YPL107W	YPL107W	747 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	LDH1	YBR204C	1128 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	DYN1	YKR054C	12279 nt		2.98	□□□□□ -1.93

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