Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
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