Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms