Protein–RNA interactions for Protein: Q08968

FMP40, UPF0061 protein FMP40, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FMP40Q08968 UTP5YDR398W 1932 nt3.62□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YGL176CYGL176C 1665 nt3.62□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 XRS2YDR369C 2565 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 KAP95YLR347C 2586 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 MTC4YBR255W 2085 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 PWP2YCR057C 2772 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 USA1YML029W 2517 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YDL162CYDL162C 357 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 MSW1YDR268W 1140 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 DPP1YDR284C 870 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 GUK1YDR454C 564 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YAL004WYAL004W 648 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YJR096WYJR096W 849 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YJR111CYJR111C 852 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 SWD2YKL018W 990 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YPL088WYPL088W 1029 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 MED8YBR193C 672 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 GCD2YGR083C 1956 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 HCA4YJL033W 2313 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YGL140CYGL140C 3660 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 AI4Q0065 1671 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 BUD27YFL023W 2391 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YDL199CYDL199C 2064 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 KIN4YOR233W 2403 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 NRP1YDL167C 2160 nt3.61□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 SMI1YGR229C 1518 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 RPO21YDL140C 5202 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 MLH2YLR035C 2088 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 QRI7YDL104C 1224 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YDR230WYDR230W 348 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YFL012WYFL012W 447 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 SPO11YHL022C 1197 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 DOG1YHR044C 741 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 SNX4YJL036W 1272 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 EMC2YJR088C 879 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 REH1YLR387C 1299 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YOR238WYOR238W 912 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 CUP9YPL177C 921 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 KIN3YAR018C 1308 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 PEX1YKL197C 3132 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 PKP2YGL059W 1476 nt3.6□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 IMD4YML056C 1575 nt3.59□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 IMH1YLR309C 2736 nt3.59□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 ACE2YLR131C 2313 nt3.59□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 GPI1YGR216C 1830 nt3.59□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 BTN2YGR142W 1233 nt3.59□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 YOL107WYOL107W 1029 nt3.59□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 WHI3YNL197C 1986 nt3.59□□□□□ -1.83
FMP40Q08968 ISM1YPL040C 3009 nt3.59□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 NCR1YPL006W 3513 nt3.58□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 PDR12YPL058C 4536 nt3.58□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 AHA1YDR214W 1053 nt3.58□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 LRS4YDR439W 1044 nt3.58□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 YDR491CYDR491C 492 nt3.58□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 YLL037WYLL037W 381 nt3.58□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 ASC1YMR116C 960 nt3.58□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 MIC27YNL100W 705 nt3.58□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 PNG1YPL096W 1092 nt3.58□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 HEF3YNL014W 3135 nt3.58□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 RRP42YDL111C 798 nt3.57□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 SCM4YGR049W 564 nt3.57□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 THP2YHR167W 786 nt3.57□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 YIR014WYIR014W 729 nt3.57□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 SOP4YJL192C 705 nt3.57□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.57□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 YML096WYML096W 1578 nt3.57□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 URA5YML106W 681 nt3.57□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 CDC5YMR001C 2118 nt3.57□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 GAC1YOR178C 2382 nt3.56□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 MIG1YGL035C 1515 nt3.56□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 SPT6YGR116W 4356 nt3.56□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 SLY41YOR307C 1362 nt3.56□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 TAM41YGR046W 1158 nt3.56□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 YHR097CYHR097C 1101 nt3.56□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 POG1YIL122W 1056 nt3.56□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 UTP11YKL099C 753 nt3.56□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 ATP20YPR020W 348 nt3.56□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 RPN2YIL075C 2838 nt3.56□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 SUC2YIL162W 1599 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 SEA4YBL104C 3117 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 AVT7YIL088C 1473 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 YOR022CYOR022C 2148 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 NTA1YJR062C 1374 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 YPR1YDR368W 939 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 ECM11YDR446W 909 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 IKI1YHR187W 930 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 MRPL20YKR085C 588 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 LIP2YLR239C 987 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 YMR087WYMR087W 855 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 NIS1YNL078W 1224 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 TPM1YNL079C 600 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 NRK1YNL129W 723 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 RET3YPL010W 570 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 RIB5YBR256C 717 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 ETP1YHL010C 1758 nt3.55□□□□□ -1.84
FMP40Q08968 SEC27YGL137W 2670 nt3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54 ms