Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms