Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
GOLGA3Q08378 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GOLGA3Q08378 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms