Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms