Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSME1Q06323 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms