Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms