Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms