Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms