Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms