Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR3Q03167 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms