Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SP4Q02446 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SP4Q02446 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SP4Q02446 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SP4Q02446 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SP4Q02446 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SP4Q02446 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SP4Q02446 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP4Q02446 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP4Q02446 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP4Q02446 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP4Q02446 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP4Q02446 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP4Q02446 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP4Q02446 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SP4Q02446 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP4Q02446 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP4Q02446 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP4Q02446 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP4Q02446 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP4Q02446 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP4Q02446 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SP4Q02446 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SP4Q02446 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms