Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XPCQ01831 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XPCQ01831 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
XPCQ01831 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XPCQ01831 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XPCQ01831 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XPCQ01831 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
XPCQ01831 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPCQ01831 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPCQ01831 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
XPCQ01831 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPCQ01831 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPCQ01831 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPCQ01831 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPCQ01831 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPCQ01831 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPCQ01831 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPCQ01831 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPCQ01831 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
XPCQ01831 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPCQ01831 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPCQ01831 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPCQ01831 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPCQ01831 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPCQ01831 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
XPCQ01831 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
XPCQ01831 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
XPCQ01831 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms