Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms