Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms