Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms