Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms