Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms