Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFI35P80217 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFI35P80217 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFI35P80217 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFI35P80217 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFI35P80217 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFI35P80217 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFI35P80217 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFI35P80217 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFI35P80217 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFI35P80217 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFI35P80217 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFI35P80217 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFI35P80217 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFI35P80217 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFI35P80217 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFI35P80217 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFI35P80217 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFI35P80217 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFI35P80217 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFI35P80217 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFI35P80217 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFI35P80217 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFI35P80217 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFI35P80217 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFI35P80217 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFI35P80217 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFI35P80217 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFI35P80217 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFI35P80217 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms