Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTHL1P78549 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms