Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX3P78415 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX3P78415 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX3P78415 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX3P78415 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX3P78415 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX3P78415 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX3P78415 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX3P78415 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX3P78415 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX3P78415 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX3P78415 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX3P78415 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX3P78415 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX3P78415 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX3P78415 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX3P78415 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX3P78415 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX3P78415 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms