Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBG1P69891 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBG1P69891 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBG1P69891 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBG1P69891 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBG1P69891 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBG1P69891 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBG1P69891 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBG1P69891 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBG1P69891 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBG1P69891 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBG1P69891 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBG1P69891 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HBG1P69891 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBG1P69891 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBG1P69891 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBG1P69891 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms