Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOMO3P69849 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms