Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms