Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms