Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms