Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S2P59780 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S2P59780 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms