Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms