Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX4P57082 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX4P57082 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX4P57082 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX4P57082 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX4P57082 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX4P57082 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX4P57082 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX4P57082 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX4P57082 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX4P57082 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX4P57082 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX4P57082 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX4P57082 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX4P57082 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX4P57082 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX4P57082 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX4P57082 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX4P57082 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX4P57082 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX4P57082 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX4P57082 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX4P57082 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX4P57082 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX4P57082 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX4P57082 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX4P57082 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX4P57082 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX4P57082 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX4P57082 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX4P57082 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX4P57082 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX4P57082 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX4P57082 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX4P57082 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX4P57082 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX4P57082 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX4P57082 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX4P57082 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX4P57082 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX4P57082 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX4P57082 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX4P57082 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX4P57082 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX4P57082 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX4P57082 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX4P57082 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX4P57082 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX4P57082 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX4P57082 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX4P57082 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX4P57082 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX4P57082 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX4P57082 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX4P57082 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX4P57082 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX4P57082 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX4P57082 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX4P57082 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX4P57082 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX4P57082 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX4P57082 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX4P57082 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX4P57082 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX4P57082 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX4P57082 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX4P57082 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX4P57082 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX4P57082 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms