Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX9P55771 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX9P55771 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX9P55771 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX9P55771 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX9P55771 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX9P55771 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX9P55771 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX9P55771 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX9P55771 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX9P55771 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX9P55771 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX9P55771 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX9P55771 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX9P55771 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms