Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSE1LP55060 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSE1LP55060 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms