Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms