Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARSP54136 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARSP54136 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARSP54136 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARSP54136 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARSP54136 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARSP54136 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARSP54136 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARSP54136 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARSP54136 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARSP54136 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARSP54136 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARSP54136 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARSP54136 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARSP54136 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARSP54136 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARSP54136 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RARSP54136 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARSP54136 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARSP54136 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARSP54136 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARSP54136 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARSP54136 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARSP54136 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARSP54136 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARSP54136 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARSP54136 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARSP54136 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARSP54136 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARSP54136 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARSP54136 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARSP54136 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RARSP54136 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARSP54136 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARSP54136 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARSP54136 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARSP54136 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARSP54136 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARSP54136 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARSP54136 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARSP54136 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARSP54136 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARSP54136 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARSP54136 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARSP54136 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARSP54136 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARSP54136 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARSP54136 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RARSP54136 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARSP54136 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARSP54136 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RARSP54136 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RARSP54136 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RARSP54136 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RARSP54136 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RARSP54136 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RARSP54136 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARSP54136 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARSP54136 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RARSP54136 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RARSP54136 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RARSP54136 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARSP54136 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARSP54136 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARSP54136 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARSP54136 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARSP54136 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARSP54136 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RARSP54136 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARSP54136 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARSP54136 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARSP54136 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARSP54136 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARSP54136 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARSP54136 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARSP54136 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARSP54136 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARSP54136 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARSP54136 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARSP54136 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARSP54136 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARSP54136 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARSP54136 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARSP54136 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms