Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMTNP53814 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMTNP53814 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMTNP53814 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMTNP53814 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMTNP53814 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMTNP53814 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMTNP53814 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMTNP53814 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMTNP53814 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMTNP53814 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMTNP53814 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMTNP53814 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMTNP53814 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMTNP53814 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMTNP53814 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMTNP53814 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMTNP53814 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMTNP53814 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMTNP53814 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMTNP53814 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMTNP53814 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMTNP53814 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMTNP53814 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMTNP53814 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMTNP53814 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMTNP53814 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMTNP53814 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMTNP53814 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMTNP53814 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMTNP53814 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms