Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms