Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KPNA1P52294 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA1P52294 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA1P52294 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA1P52294 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA1P52294 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA1P52294 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA1P52294 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms