Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP11P51784 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP11P51784 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP11P51784 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP11P51784 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP11P51784 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP11P51784 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP11P51784 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP11P51784 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP11P51784 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP11P51784 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP11P51784 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP11P51784 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP11P51784 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP11P51784 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP11P51784 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP11P51784 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP11P51784 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP11P51784 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP11P51784 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP11P51784 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP11P51784 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP11P51784 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP11P51784 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP11P51784 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP11P51784 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP11P51784 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP11P51784 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP11P51784 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP11P51784 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP11P51784 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP11P51784 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP11P51784 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP11P51784 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP11P51784 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP11P51784 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP11P51784 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP11P51784 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP11P51784 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP11P51784 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP11P51784 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP11P51784 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP11P51784 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP11P51784 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP11P51784 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP11P51784 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP11P51784 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP11P51784 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP11P51784 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP11P51784 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP11P51784 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP11P51784 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP11P51784 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP11P51784 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP11P51784 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms