Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNN1GP51170 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms