Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB27AP51159 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms