Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8P50990 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8P50990 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8P50990 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8P50990 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT8P50990 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT8P50990 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT8P50990 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT8P50990 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT8P50990 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT8P50990 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT8P50990 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT8P50990 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT8P50990 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT8P50990 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT8P50990 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT8P50990 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT8P50990 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT8P50990 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT8P50990 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT8P50990 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT8P50990 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT8P50990 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT8P50990 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT8P50990 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT8P50990 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT8P50990 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT8P50990 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT8P50990 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT8P50990 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT8P50990 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT8P50990 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT8P50990 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT8P50990 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT8P50990 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT8P50990 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT8P50990 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT8P50990 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT8P50990 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT8P50990 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT8P50990 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms