Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATMP50440 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATMP50440 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATMP50440 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATMP50440 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATMP50440 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATMP50440 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATMP50440 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATMP50440 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATMP50440 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATMP50440 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATMP50440 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATMP50440 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATMP50440 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATMP50440 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATMP50440 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATMP50440 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GATMP50440 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATMP50440 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATMP50440 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GATMP50440 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATMP50440 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATMP50440 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATMP50440 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATMP50440 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATMP50440 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATMP50440 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATMP50440 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATMP50440 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATMP50440 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATMP50440 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GATMP50440 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GATMP50440 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATMP50440 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATMP50440 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GATMP50440 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATMP50440 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATMP50440 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATMP50440 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GATMP50440 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATMP50440 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATMP50440 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATMP50440 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATMP50440 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATMP50440 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATMP50440 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATMP50440 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATMP50440 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATMP50440 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATMP50440 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATMP50440 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATMP50440 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATMP50440 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATMP50440 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms